2016年7月，武汉降雨量突破历史最高记录。华中农业大学校园位于南湖地区，周边的南湖、野芷湖、汤逊湖水位暴涨，三湖的桥面、路面及周边地区连城一片，大水淹没了校园内部分道路、实验田地及公共设施。校园内狮子山山体发生多起地质灾害。暴雨及长时间雨水浸泡导致山体发生多次滑坡。部分楼栋房屋受损，教学科研基地遭受水灾，道路、电力和下水管网等公共设施受损，部分电力设施受损，部分教学科研仪器设备受损。

学校积极抗灾减灾，保安全，保运行，保秩序，成立工作专班，启动应急预案，24小时应急反应，全力救灾减灾，第一时间转移安置居民，紧急处置危险隐患，抢修水电气路等公共设施，加固有关区域建筑或树木，开展校园排水作业，储备防汛防洪物资，对周边湖面实行警戒值守，保障了教学科研秩序。

经第三方严谨测算、科学论证，认定我校受灾损失1亿余元。